По возвращении в Петербург Обручев продолжил контакты с Чернышевским и Добролюбовым во время следствия по делу своего двоюродного брата. Вместе с Некрасовым и Чернышевским он подписал некролог Добролюбова. Из перечисленных фактов Н. Н. Новикова делает вывод о возможной причастности Н. Н. Обручева к комитету «Великорусса» и «Земле и воле»²²⁵, что кажется мне попыткой принять либеральные настроения за либерализм. (Вспомним, что Герцена посещали и братья Ростовцевы, а генерал-губернатор Петербурга А. А. Суворов подписался в листе пожертвований в пользу заключенного в крепость Чернышевского.) Вряд ли можно серьезно рассматривать эти отрывочные сведения как доказательство революционности Н. Н. Обручева и его участие в судьбе арестованного брата. В семье Обручевых родственные отношения были достаточно крепкими, родители Николая Николаевича были крестными отцом и матерью В. А. Обручева, крещенного в Нововаршавской цитадели. На основании документов личного архива семьи Обручевых можно утверждать, что Эмилии Францевне Обручевой в хлопотах о сыне помогал не только Николай Николаевич, но и Бычковы, Сеченов и др. родственники, причем не только в 1861–1862 годах, но и во все время, пока В. А. Обручев находился в заключении²²⁶. Освобожден он был в 1872 году. Северную столицу Владимир Афанасьевич сумел посетить лишь в декабре 1878 года. Сам В. А. Обручев счел необходимым отметить дружелюбный прием, оказанный ему главой III отделения С. Е. И. В. К. – ген. – ад. А. Р. Дрентельном – бывшим измайловцем и приятелем Н. Н. Обручева²²⁷. Родные тепло встретили «блудного родственника», успевшего, кстати, восстановить свое положение под огнем турок на Дунае. В. А. Обручев вспоминал: «…с особенной, душевной благодарностью должен упомянуть прием любящей и доброй воспитательницы моих корпусных лет, М. Л. Обручевой (матери Н. Н. Обручева. – О. А.), пожелавшей придать моему возвращению характер семейного торжества, к которому были приглашены все бывшие в Петербурге родные»²²⁸. Дружеские отношения между братьями продолжились – В. А. Обручев даже посещал имение Николая Николаевича во Франции²²⁹. Но это было потом. А 31 мая 1862 года В. А. Обручев был осужден.

Военный министр, крайне негативно относившийся к подобного рода случаям, перечислил в воспоминаниях старших офицеров, подвергшихся революционному или либеральному влиянию, но Н. Н. Обручева среди них нет, хотя «…в 1862 году за политические преступления подверглись формальному следствию и суду до 130 офицеров, в том числе четыре штаб-офицера, 15 капитанов и штабс-капитанов и 111 младших чинов»²³⁰. Думается, что говорить о причастности Н. Н. Обручева к деятельности комитета «Великорусс» можно лишь с большой натяжкой, ибо документов, подтверждающих этот факт, не найдено.

В начале шестидесятых годов важная перемена произошла и в личной жизни Обручева. Сразу же по окончании Крымской войны по приказу Я. И. Ростовцева было разрешено командировать по два офицера, обычно причисляемых к Генеральному штабу, с ознакомительными целями в европейские армии. Первая командировка состоялась в 1856 году, вторая – в 1858 году (поехали близкие знакомые Обручева – подполковник Макшеев – профессор Военной статистики в Академии и штабс-капитан Драгомиров)²³¹.