Летом 1999 года Павел Капыш был убит. Костя Могила присутствовал на его отпевании в храме, держался за гроб и всячески подчеркивал свое доброе отношение к покойному магнату. Вскоре после похорон Яковлев появился в кабинете Виталия Рюзина, возглавившего БФПГ. Насколько нам известно, Константин Карольевич в достаточно жесткой форме предложил Рюзину заменить всю службу безопасности фирмы на своих людей, а также чтобы он, Костя Могила, стал первым лицом БФПГ. Другими словами, речь шла о пресловутой крыше. Виталий Рюзин просил Яковлева подождать, не решаясь ни согласиться, ни отказать. Было ещё несколько встреч с таким же результатом. Тем не менее, в городе поползли слухи о том, что Яковлев всё же стал одним из теневых хозяев БФПГ.

В последние годы бизнес-империя Константина Яковлева все больше слабела. Он был уже не тем Костей Могилой образца 1990-х годов: бизнесом занимался интеллигентно, обзавелся большой библиотекой, много времени проводил за пределами Петербурга (чаще всего в Москве и за границей), стал очень религиозным. Некоторые несвязанные между собой источники считали, что к моменту смерти Яковлева команды у него уже не было: кто-то стал заниматься собственным бизнесом, кто-то пошел в политику и во власть.

Костя Могила был застрелен 25 мая 2003 года в Москве. Автомобиль «Ниссан Максима», в котором помимо Яковлева находились его телохранитель, водитель и знакомая девушка, в лучших традициях итальянского кино про мафию расстрелял из автомата киллер-мотоциклист. Все находившиеся в машине мужчины от полученных ранений скончались на месте, а женщина, случайно нагнувшаяся за доли секунды до стрельбы, получила тяжелые ранения, но смогла выжить.

Поскольку убийство произошло в разгар юбилейных торжеств по случаю 300-летия Санкт-Петербурга, до окончания «протокольных мероприятий» питерские власти запретили проводить похороны Яковлева. В результате покойник почти десять дней дожидался погребения в московском морге, дабы не мешать горожанам и гостям Северной столицы веселиться.

Из интервью с Андреем Константиновым, взятого вскоре после убийства Константина Яковлева:

- Андрей, можно в двух словах оценить масштаб личности Кости Могилы? Это действительно была фигура номер один в криминальном мире города?

- Константин все-таки никогда не был первым номером. Хотя были периоды, когда он мог претендовать на эго. Все ведь относительно в этих соревнованиях. Но последнее десятилетие, конечно, входил в «хитовую тройку» Питера. В конце 90-х фактически были две таких топ-фигуры по авторитетному влиянию - он и Кумарин Правда, в последние годы в Питере у Кости не слишком здорово разворачивались дела. Он во многом утратил здесь свое влияние. По крайней мере так об этом говорят.

- Он сам переключился на Москву или его вытеснили из Питера?

- Криминальный мир вообще очень изменился в последние годы. Роль таких фигур, как Костя Могила, несколько снизилась. Деньги оставались, но былого влияния не было. Обстановка в городе стала другой…..

- В газетах опубликовано множество различных версии убийства Кости Могилы, Какая из них вам кажется наиболее вероятной?

- Говорить о версиях в данной ситуации абсолютно не корректно. Да, был конфликт между Костей и Кумариным, но он совеем не единственный. В последние годы многие интересы Константина были связаны с Москвой. Какие у него там образовались конфликты, кто знает?

- Очень много слухов о его связях с московскими ворами.