Невзирая на категорический запрет Адольфа Гитлера, «папаша» Гауссер осуществил прорыв и эвакуировал Харьков, счастливо избежав судьбы генерал-фельдмаршала Фридриха Паулюса под Сталинградом. В ходе Третьего сражения за Харьков в феврале 1943 года Гауссер командовал левым флангом германской группировки и 9 марта, разгромив советскую 6-ю армию генерала М.М. Попова, ворвался в город, а к 14 марта захватил весь Харьков. В ходе битвы на Курской дуге II танковый корпус СС под командованием Пауля Гауссера (входивший в состав 4-й танковой армии генерал-оберста Германа Гота), уничтожил не менее 1150 советских танков.

В конце июля того же года, в связи со свержением Бенито Муссолини группой военных заговорщиков во главе с маршалом Бадольо, заявившим о выходе Италии из войны, началась переброска частей корпуса Гауссера (в первую очередь — 1-й танковой дивизии СС Лейбштандарт СС Адольфа Гитлера) в Северную Италию. 28 июля 1943 года Пауль Гауссер удостоился награждения Дубовыми листьями к Рыцарскому кресту Железного креста. В декабре 1943 года II танковый корпус СС был передислоцирован во Францию, где в его состав, кроме 1-й танковой дивизии СС Лейбштандарт СС Адольфа Гитлера, вошли недавно сформированные 9-я бронегренадерская (мотопехотная) дивизия СС Гогенштауфен и 10-я бронегренадерская (мотопехотная) дивизия СС Фрундсберг.

В апреле 1944 года бронегренадерские (мотопехотные) дивизии СС были преобразованы в танковые, и корпус Гауссера был переброшен на германо-советский фронт. В июне 1944 года «зеленые эсэсовцы» Пауля Гауссера были в очередной раз сняты с Восточного фронта и снова переброшены во Францию, где уже шло сражение за Нормандию с высадившимися там в «день Д» западными союзниками. 29 июня 1944 года Пауль Гауссер был назначен командующим германской 7-й армией, защищавшей Нормандию от англосаксов.

25 июля войска западных «союзников» начали крупномасштабное наступление на 7-ю армию Гауссера, смяв ее в ходе ожесточенного трехдневного сражения. К 17 августа вверенные Паулю Гауссеру войска попали в так называемый «Фалезский котел». Приказав своим частям группами прорываться из окружения, «папаша» Гауссер присоединился к 1-й танковой дивизии СС Лейбштандарт СС Адольфа Гитлера, вместе с которой вышел из окружения. При выходе из окружения Пауль Гауссер был в очередной раз тяжело ранен. 26 августа 1944 года он был награжден за проявленную доблесть Мечами к Дубовым листьям своего Рыцарского креста Железного креста. 23 января 1945 года Гауссер сменил на посту командующего группой армий Верхний Рейн рейхсфюрера СС Генриха Гиммлера, не проявившего ожидавшихся от него Адольфом Гитлером полководческих талантов. 29 января 1945 года группа армий Верхний Рейн была расформирована, а Пауль Гауссер был назначен командующим группой армий Г (в составе 1-й, 7-й и 19-й германских армий), силами которой ему было приказано оборонять Южную Германию.

Ввиду вопиющего неравенства сил, Гауссер 2 апреля 1945 года запросил у Гитлера разрешения отступить в глубь Германии, но добился только приказа фюрера о своей немедленной замене генералом от инфантерии Фридрихом Шульцем. Махнув на все рукой, «папаша Гауссер» в мае 1945 года сдался в плен американцам. Однако оружия он не сложил, и на заседаниях Международного военного трибунала в Нюрнберге выступал в качестве главного свидетеля защиты СС. За что и был осужден и приговорен к 2 годам трудовых лагерей. После выхода на свободу он активно участвовал в деятельности Общества взаимопомощи бывших военнослужащих Ваффен СС (ХИАГ) написал киигу «Войска СС в бою» (известную также под другими названиями — «Такие же солдаты, как и все», «Солдаты, как все остальные»).

«Папаша» Гауссер умер 21 декабря 1972 год в вюртембергском городе Людвигсбурге.