Летний переход по Кускокуиму готовился на четырёх гребных байдарах, как только прошёл лёд на реке и зазеленел кустарник на берегах. Сначала шли вверх, временами впрягаясь в бечеву. Небольшой отрезок пути пролёг среди крутых гранитных берегов, напоминающих «щёки» Енисея и Лены.

Немного не дойдя до истока Кускокуима, Загоскин повернул назад. «Дела компании не ждали, — записал он в своём дневнике, — с грустью принуждены мы были обратиться назад». Плыли к устью Юкона — Квихпака. Река становилась всё шире, убыстрилось её течение. Останавливаясь только для астрономических наблюдений, 17 июня 1844 года достигли моря. Здесь вдоль берега поплыли к Михайловскому редуту, где были через четыре дня. Восемнадцать с половиной месяцев назад исследователи вышли в поход, в течение которого преодолели по Аляске на нартах, пешком и байдарах около пяти тысяч километров.

Из Михайловского редута на судне «Охотск» Загоскин отправился со своими спутниками в Ново-Архангельск.

Это была самая большая русская экспедиция на Аляске. И результаты её значительны: 40 астрономических определений, описания рек, гор, селений туземцев, этнографические наблюдения, коллекции горных пород, растений и животных. Через три года в Санкт-Петербурге выйдет в свет «Пешеходная опись части русских владений в Америке, произведённая лейтенантом Л. Загоскиным в 1842, 1843 и 1844 годах». Журнал «Сын отечества» назвал её «столь же занимательной для обыкновенных читателей, сколько полезной для учёных».

Впервые были составлены Загоскиным словари племён индейцев Аляски, даже названия которых теперь забыты. Эти наречия сравнены с языком племён, проживающих по берегам Берингова моря.

Загоскин хотел поставить редут в заливе Коцебу, к северу от полуострова Сьюард, прямо у полярного круга. Но из-за трудностей с продовольствием отказался от этой затеи. Он остался на берегу залива Нортон: нанёс на карту реки, впадающие в залив, основательно изучил этнографию эскимосских племён, составил сравнительный словарь их языков.

В начале мая 1842 года на бриге «Охотск» Загоскин прибыл в редут Св. Михаила. А 4 декабря отряд Загоскина с пятью нартами и собачьими упряжками отправился во внутренние районы Аляски. Через неделю достигли устья реки Уналаклик, вдоль которой двинулись дальше. В первый новогодний день прибыли в селение Улукак, жители которого очень тепло отнеслись к путникам, проводили их дальше, в глубинные районы полуострова.

Почти неделю исследователи ехали по безлюдной холмистой тундре с остатками горелого редколесья. Нарты то и дело опрокидывались в глубокий снег. Его пришлось утаптывать шедшим перед упряжкой проводникам. Когда им удавалось за день уйти далеко вперёд, ночью образовывался на снегу наст, и с утра собаки легко везли нарты. Но с каждым днём мороз становился сильнее, вот уже замёрзла ртуть в термометрах; только в движении можно было как-то согреваться.

Наконец была достигнута великая река Аляски Юкон, длиной не меньше Волги. Одни индейские племена называли её Квихпак, другие (атабаски) — Юкхан. Юкон — искажённое атабасское название. В индейском селении отогрелись, отдохнули и в середине января пришли в Нулато, где зимовала русская артель охотников. Здесь Загоскин обосновался надолго, совершая разведывательные походы, готовился к переходу — к заливу Коцебу, где в соответствии с инструкцией должен был устроить редут.

Ниже селения Нулато Юкон протекал мимо величественных холмов с обнажениями зелёной яшмы на правом берегу и строевого леса из высоких сосен на левом. Вниз по великой реке до конца августа 1843 года путешественники проплыли вёрст семьсот. Остановились в селении Инкогмют, которое надолго стало исходным пунктом для походов. Здесь были изучены возможности перехода с Квихпака на Кускокуим.