Окольничество получили следующие лица: И. И. Сабуров, С. Ф. Сабуров, Я. М. Годунов, Д. И. Вельяминов, князь П. С. Лобанов-Ростовский, князь Д. П. Елецкий, А. П. Клешнин, М. Г. Салтыков, князь А. И. Хворостинин, князь И. В. Гагин, Н. И. Плещеев, Б. П. Засекин, И. М. Бутурлин и И. С. Туренин. Кравчим был назначен А. Н. Романов (брат Ф. Н. Романова и двоюродный брат царя).

В итоге можно так реконструировать состав Боярской думы при царе Федоре Ивановиче.

Боярами являлись: князь Ф. И. Мстиславский, князья B. И. Шуйский, Д. И. Шуйский, Анд. И. Шуйский и И. И. Шуйский, князья Н. Р. и Т. Р. Трубецкие, Д. И. Годунов, Б. Ф. Годунов (конюший), Г. В. Годунов (дворецкий), C. В. Годунов, И. В. Годунов (глава Стрелецкого приказа), Ф. Н. Романов, князь Ф. Д. Шестунов, князь Ф. М. Троекуров, князь И. В. Сицкий, Ф. В. Шереметев, князь Г. А. Куракин, князь А. П. Куракин, князья И. М. Голицын, И. И. Голицын и А. И. Голицын, князь Б. К. Черкасский, князь Ф. И. Хворосинин, князь Д. И. Хворостинин, князь И. М. Воротынский, князь В. А. Гагин.

Окольничими были следующие лица: Я. М. Годунов, С. Ф. Сабуров, Д. И. Вельяминов, М. Г. Салтыков, Н. И. Очин-Плещеев, Б. П. Засекин, И. М. Бутурлин, И. С. Туренин.

В Боярскую думу входили и думные дворяне: P. M. Пивов (глава Ямского приказа), И. П. Татищев, Е. Л. Ржевский, князь Т. И. Буйносов, казначей Д. И. Черемисинов, казначей И. В. Траханиотов, печатник Р. В. Алферьев, думный дьяк А. Я. Щелкалов (глава Посольского приказа), его брат В. Я. Щелкалов (глава Разрядного приказа), дьяк Е. Вылузгин (глава Поместного приказа).

Перечень вошедших в Боярскую думу представителей знати показывает, что Федор Иванович стремился к определенному равновесию между ними и не выделял какую-либо одну фамилию. Это позволяло сохранять устойчивость в обществе.

Хотя некоторые польские современники царя Федора пытались представить его в своих сочинениях слабоумным и недееспособным человеком (Л. Сапега), в 1587 г. на сейме активно обсуждался вопрос об избрании русского государя на польский трон. Препятствием для этого стали только различия в вероисповедании и нежелание Федора Ивановича считаться в первую очередь польским королем, а потом уж русским царем.

Большим достижением царя Федора следует считать учреждение в Москве патриаршества. В официальных документах прямо писалось, что инициатором этого важного дела был сам государь.

Отрывок из Уложенной грамоты об учреждении Московского патриархата. Май 1589 г.

«Изволением человеколюбца Бога и пречистые Богородицы… приде к нам, к великому государю благочестивому царю и великому князю Федору Ивановичу… в царствующий град Москву Еремей, архиепископ Костянтинополя… и святейший вселенский патриарх, а с ним манавасийский митрополит Ерофей, да архиепископ Еласонский Арсений, и архимандриты, и игумены, и священноиноки, и честныя мнихи.

И мы, велиий государь царь и великий князь Федор Иванович… помыслив о сем превеликом деле с нашею з благоверною и христолюбивою царицею великою княгинею Ириною, чтоб з Божиею помощею… в царствующем нашем граде Москве устроити превеликий престол патриарш… и мысль свою царьскую пресветейшему Еремею… объявили…

И слыша таковая от благочестивого великого государя царя и великого князя Федора Ивановича… пресвятейший Еремей… похвалил мысль и изволение благочестивого и христолюбивого… царя… и глаголаше сице: «О благоверный и христолюбивый, и Богом венчанный, и Богом почтенный, и Богом украшенный… царь и великий князь Федор Иванович, всея Великия Росия самодержец и многих государств государь и обладатель, истинный рачитель благочестию… премудрый исходатай и благоразумный поспешник истине, искатель отеческому преданию… хощеши почтити и украсити святую превеликую соборную церковь Пресвятыя Богородицы честнаго ея Успения превысоким престолом патриаршества.