В 2004 году противостояние настолько обострилось, что глава управления безопасности в правительстве ПА Мохаммед Дахлан заявил: «Или мы, или ХАМАС. Две партии на верхушке автономии ужиться не смогут». Со временем дошло и до открытых военных действий. За семь суток боёв в июне 2007 года в секторе Газа было убито 116 человек и 550 человек ранено. Израиль закрыл свою границу с Газой, и тысячи жителей сектора, в том числе европейские и русские женщины, вышедшие замуж за арабов Газы, не могли выехать на родину.

Израильские власти опасались, что в потоке беженцев могут оказаться террористы. Хотя в Газе находилось более 20 тысяч сотрудников различных силовых структур, подчинённых президенту ПА Абу Мазену, тот показал полное бессилие, что привело к победе ХАМАС. Лига арабских государств на чрезвычайном заседании в Каире 16 июня потребовала от ХАМАС прекращения кровопролития в Газе. Заседание оказалось бурным, так как Йемен и Сирия выступили против осуждения ХАМАС и требовали почему-то осудить Израиль.

В результате принятого решения Израиль вообще не упоминается, а Египет, Кувейт, Саудовская Аравия и Объединённые Арабские Эмираты отказались финансировать ХАМАС. Россия призвала «все палестинские организации сделать всё возможное для прекращения огня», но никак не осудила зачинщиков кровопролития: Сирию, Иран, «Хизбаллу» и ХАМАС.

События в Газе вызвали беспокойство в Иордании. Ведь палестинцы являются там доминирующим большинством. Поэтому эскалация напряжённости на территории ПА может отразиться на стабильности в Иордании. Это привело к тому, что начались разговоры об идее иордано-палестинской конфедерации как более эффективной форме разрешения палестинской проблемы. Правда, король Иордании Абдалла Второй пока что негативно относится к этому. Однако и в его окружении уже понимают, что времена меняются.

В феврале 2006 года ХАМАС победил на выборах в ПА и мог формировать правительство. Ситуация ещё более обострилась. Ни правительство во главе с хамасовцем Исмаилом Ханией, ни председатель автономии Абу Мазен не способны что-нибудь изменить к лучшему. Фактически ситуацией управляют шейхи, а мухтары выполняют функции арбитров.

Тысячи боевиков оперативных подразделений ХАМАС получают современное оружие, им доставляются продукты и выплачивается хорошее ежемесячное пособие. Представители ФАТХ, в том числе сотрудники структур национальной безопасности, этого лишены. Более полугода они не получают зарплату, что вызывает у них недовольство сложившейся ситуацией.

Правительство ХАМАС запрещает больным палестинцам ехать на лечение в Израиль «из-за бюджетных проблем». Однако для приближённых к власти и их родственников палестинский Минздрав средства легко находит. В ХАМАС началась такая же волна коррупции, которая в своё время захлестнула ФАТХ. Новое правительство уже назначило на руководящие должности 11 тысяч родственников министров, а также их приближённых, друзей и соседей. В своём административном аппарате министры назначили 67 новых гендиректоров, их заместителей и помощников, а также 300 консультантов с огромными окладами.

Миллионы незаконно поступающих в казну ПА долларов остаются у коррумпированных министров и чиновников. Часть поступающих средств идёт на вооружение. По данным военной разведки, ХАМАС создаёт в Газе регулярную армию, с ротами и батальонами, укомплектованными современным оружием, поставляемым через сотни туннелей.

В противовес этому Израиль разрешил передачу ФАТХ 50 БТР российского производства. В то же время ЦАХАЛ выражает недовольство этим решением, так как БТР, переданные ранее Россией властям ПА в Газе, оказались впоследствии на вооружении у ХАМАС.