Несколько лет после этого «Манчестер Юнайтед» опять оставался середнячком. Однако уже в начале 60-х годов в клубе появились такие звезды, как Денис Лоу и Джордж Бест, а рядом с ними блестяще действовал «старожил» клуба Бобби Чарльтон. «Манчестер» возрождался, вновь показывая эффективную атакующую игру. В 1963 году клуб выиграл Кубок Англии, в сезонах 1964–1965 и 1966–1967 годов становился чемпионом страны. Высшим же тренерским достижением Мэтта Басби стал выигрыш Кубка европейских чемпионов в 1968 году.

В финале «Манчестер» встречался с португальской «Бенфикой», игра выдалась очень упорной, основное время закончилось со счетом 1:1. Но уже в начале дополнительного времени Джордж Бест, обманув серией финтов нескольких защитников, забил второй мяч. Он внес перелом в игру, после этого англичане забили еще два гола и победили со счетом 4:1. Эта великая победа, первая победа английского клуба в главном европейском клубном турнире, была одержана через 10 лет после мюнхенской трагедии — как великая дань памяти всем погибшим.

Мэтт Басби возглавлял «Манчестер Юнайтед» в качестве тренера 24 года. За это время, кроме победы в Кубке европейских чемпионов, клуб 5 раз становился чемпионом Англии, дважды выигрывал Кубок Футбольной ассоциации, и 5 раз завоевывал Суперкубок Англии. Однако в два следующих десятилетия, при других тренерах, успехи «Манчестера» были скромнее. Победить в чемпионатах Англии больше не удавалось. Тем не менее в 1977, 1983 и 1985 годах клуб выигрывал Кубок Футбольной ассоциации, а в 1983 году еще и Суперкубок Англии. А впереди был новый, фантастический подъем.

В 1986 году «Манчестер Юнайтед» возглавил шотландец Алекс Фергюсон, до этого тренировавший несколько клубов своей родной страны, а потом и сборную Шотландии. Самой сильной стороной этого тренера всегда было умение подобрать хороший состав и найти для игроков наиболее подходящие для них позиции. Однако в английском городе Манчестере шотландца Фергюсона поначалу встретили настороженно, да и дела у него здесь пошли далеко не сразу. «Манчестер» терпел поражение за поражением, иной раз с крупным счетом.

Тем не менее в сезоне 1987–1988 годов Фергюсон вывел свой новый клуб на второе место, однако от чемпиона «Ливерпуля» «Манчестер» отстал на 9 очков. Затем последовал новый спад. В конце 1989 года Фергюсон балансировал на грани увольнения, кредит доверия руководства клуба был исчерпан. Последний шанс был предоставлен тренеру в матче одной тридцать второй финала Кубка Англии против клуба «Ноттингем Форест», состоявшемся 7 января 1990 года. С огромным трудом «Манчестер» одолел соперника, и после этого началось медленное, но верное возрождение великого клуба. Прежде всего весной 1990 года он выиграл Кубок Англии.

Уже в начале 90-х годов Фергюсону удалось собрать великолепный состав звездных футболистов. Место в воротах занял великий датский вратарь Петер Шмейхель, в полузащите заиграли француз Эрик Кантона, ирландец Рой Кин, валлиец Райан Гиггз, чуть позже Дэвид Бекхэм, в нападении действовал Тедди Шерингем, прекрасно себя проявляли Ники Батт, Пол Скоулз, братья Невиллы. Многие юные таланты, как, например, Гиггза, Фергюсон открыл сам и лично ездил к нему домой, чтобы убедить перейти в «Манчестер». По-прежнему в команде играл многоопытный Брайан Робсон, ветеран английского футбола.

Вслед за Кубком Англии в 1991 году Алекс Фергюсон выиграл Кубок обладателей кубков — в финальном матче «Манчестер Юнайтед» обыграл «Барселону» — 2:1. В том же году был выигран и европейский Суперкубок.