Лжедмитрий II осаждал Москву почти два года. Временами владения самозванца не уступали по территории владениям властителя Кремля. Наличие двух царей полностью парализовало государственную власть и сделало Россию легкой добычей для соседей.

В феврале 1609 года Россия заключила договор со шведами. Шведский король прислал наемное войско.

Союз России и Швеции дал повод Сигизмунду III разорвать перемирие с русскими. Осенью 1609 года король осадил Смоленск. Началась беспримерная оборона Смоленска, длившаяся более двадцати месяцев.

В Тушино прибыли королевские послы, не пожелавшие иметь дело с самозванцем и начавшие переговоры с его боярами.

Спасая голову, самозванец бежал в Калугу, куда за ним потянулись казачьи отряды.

Король старался привлечь тушинскую знать на сторону Польши. Послы убеждали Филарета и бояр в том, что король пришел в Россию с единственной целью – взять русских под защиту и освободить их от тирана. Лицемерие послов не смутило тушинцев.

В ходе переговоров в Тушино патриарх Филарет и бояре предложили Сигизмунду III возвести на царский престол его сына королевича Владислава. Договор был подписан в королевском лагере под Смоленском. Однако тушинский лагерь распался, и его правительство никого более не представляло.

В течение нескольких лет Филарет Романов лелеял мысль о том, что ему удастся с помощью самозванца покончить с властью Шуйского. Зная Лжедмитрия I, Романов нимало не сомневался, что в Тушино он служит проходимцу и обманщику. Но он был уверен, что стародубский «вор» недолго будет сидеть на троне.

Патриарх Филарет плакал, целуя королевские грамоты. Он поддержал идею избрания королевича Владислава на царский трон и заключения личной унии России и Речи Посполитой.

Некогда бояре Василий Шуйский и Василий Голицын, стремясь избавиться от Лжедмитрия I, предложили шапку Мономаха сыну короля Сигизмунда. Тушинцы возродили этот проект, чтобы избавиться от самого. Шуйского.

Идея унии Речи Посполитой и России, имевшая ряд преимуществ в мирных условиях, приобрела зловещий оттенок в обстановке вражеского вторжения. Тысячи неприятельских солдат вели осаду Смоленска, захватывали, жгли и грабили русские города и села.

Филарет принял участие в разработке договора с королем о порядке передачи трона Владиславу. Для утверждения договора под Смоленск выехали Михаил Глебович Салтыков, Михаил Молчанов и другие лица. Русские статьи соглашения от 4 февраля 1610 года предусматривали, что Владислав Жигимонтович «произволит» принять греческую веру и будет коронован московским патриархом по православному обряду. Ответ короля на этот пункт тушинских «статей и просьб» носил двусмысленный характер. Сигизмунд не принял никаких обязательств по поводу отказа сына от католичества.

Смоленский проект соглашения окончательно осложнил и без того запутанную обстановку в России. Рядом с законным царем в Москве и «воровским» – в Калуге появился то ли королевич, то ли царь Владислав.

Филарет Романов выехал из Тушино с последними польскими отрядами с тем, чтобы найти пристанище в королевских обозах под Смоленском. Но ему не удалось благополучно добраться до места назначения. Войска Валуева пленили его после боя под Волоколамском и отправили в Москву.

Царь Василий не осмелился судить «воровского» патриарха и опрометчиво разрешил ему остаться в столице. Гермоген поспешил объявить Романова пленником и жертвой Лжедмитрия II и признал его право на прежний сан ростовского митрополита.

Возвращение Филарета в столицу положило начало возрождению былого влияния романовского круга.