Помимо этого, в Администрацию Президента РФ ФЭП поставлял свои информационно-аналитические разработки, содержащие анализ и оценку материалов, опубликованных за неделю в федеральных и региональных средствах массовой информации и прямо или косвенно затрагивающих интересующую Кремль тематику. В этом смысле ФЭП позиционирует себя как центр анализа информационно-политического поля для президентских структур.

В рамках сотрудничества с Кремлем ФЭП принимал непосредственное участие в подготовке парламентских выборов 1999 года, работал над формированием блока «Медведь». Позже Павловский назовет себя идеологом «Единства», что не вполне соответствовало действительности. Говорили, что и идея создания «Центра стратегических разработок» принадлежала Павловскому, которого даже прочили в его руководители. Хотя эти сообщения не подтвердились, специалисты ФЭПа очень активно работали и продолжают работать в Центре стратегических разработок (ЦСР) Германа Грефа. В частности, в здание на Якиманке был откомандирован Максим Мейер.

Активное участие ФЭП принимал и в подготовке выборов Президента РФ в марте 2000 года, после удачного завершения которых Павловский окончательно закрепил за собой статус «серого кардинала Кремля».

Отдельным направлением работы ФЭПа являются, как мы уже упоминали, интернет-проекты. Вообще, фонд стал одной из первых в России структур, профессионально занявшейся разработкой, созданием и поддержанием интернет-проектов, а, кроме того, обеспечивающей их высокий содержательный уровень. С лета 1997 года в сети ФЭП начал поддержку сетевого ежедневного издания «Русский журнал» (www.russ.ru). В 2001 году на базе «Русского журнала» было создано сетевое обозрение «Религия в России». В декабре 1998 года ФЭП запустил одну из первых ежедневных сетевых газет (www.gazeta.ru), главным редактором которой стал Антон Носик (позже ушел в МедиаМостNetworks). Затем в сентябре 1999 года был запущен проект новостной ленты www.lenta.ru, в октябре 1999 года — ежедневной интернет-газеты «Вести» (www.vesty.ru), проект «СМИ.RU: Информация и дезинформация» (www.smi.ru).

Интернет-сайты «Московская альтернатива» и «Неофициальная Москва» создавал и поддерживал именно ФЭП. Он же поддерживает интернет-странички Бориса Немцова и Сергея Кириенко и сетевой проект «Интернет-парламент» (www.elections.ru), к созданию которого имел непосредственное отношение Сергей Кириенко. В рамках кампаний по выборам депутатов Государственной Думы РФ в декабре 1999 года и выборов Президента РФ в марте 2000 года ФЭП осуществил проект по публикации в интернете результатов exit polls, то есть опросов уже проголосовавших избирателей. Хотя результаты exit polls не совсем соответствовали действительности, общие закономерности парламентских выборов они продемонстрировали (в частности, высокий результат «Единства»). Из-за этой акции у ФЭПа возникли осложнения с Центризбиркомом, который расценил действия фонда как нарушение избирательного законодательства. Однако судебного разбирательства не состоялось.

В 2000 году фонд создал экспертный сайт VVP.ru, где было организовано обсуждение экспертным сообществом проблем и задача, стоящих перед Президентом России Владимиром Путиным.

Весной 2001 года ФЭП создал сайт журнала «Фас» (Михаил Леонтьев), в ноябре 2001 года фонд открыл интернет-сайт «Гражданского форума».

Последние интернет-проекты ФЭПа финансировались со стороны президентской Администрации и соответственно получали соответствующее идеологическое наполнение. Первым таким проектом стало создание в 2000 году национальной информационно системы Страна.Ру. Этот проект претендует на роль своеобразного сетевого официоза. В 2001 году была создана аналогичная система, посвященная Украине — информационный центр Украина.