Кроме того, нарушение дифференцировки мозга может быть обусловлено различными вредными воздействиями на плод во внутриутробном периоде, в том числе применением некоторых лекарственных препаратов.

Выраженность нарушений половой дифференцировки может быть различной. Поэтому проявления транссексуализма многообразны. Могут быть яркие и даже гротескные формы (сексопатологи называют их "ядерными"), но могут быть и стертые, менее выраженные, проявляющиеся незначительными эпизодами в детстве, когда ребенок заявляет о своей принадлежности к другому полу — так называемые "краевые" варианты.

Американские психиатры Б.Сэдок и Г.Каплан считают, что причиной транссексуализма являются и условия воспитания — если с детства родители поощряют или даже навязывают ребенку стереотип поведения, соответствующий поведению противоположного пола (это нередко бывает, когда родители хотели девочку, а рождается мальчик и наоборот), например, решительность, активность у девочек, и мягкость, подчиняемость, женоподобность — у мальчиков, а также одевают ребенка в одежду противоположного пола, прививают ему соответствующие привычки <style name="TimesNewRoman">и увлечения.

Однако отечественные сексопатологи Г.С.Васильченко, В.М.Маслов и другие считают, что утверждения о том, что транссексуализм возникает при попытках воспитывать ребенка в другом поле, не имеют под собой никакой основы, поскольку когда проявления транссексуализма у ребенка начинают восприниматься у окружающих как патология, половое самосознание оказывается уже сформированным (до 5 лет) и любые воспитательные меры не могут его изменить. И во-вторых, для коренного изменения поведения и половой роли лишь воспитательными мерами требуется не только время, но и стремление самого пациента.

Американский психиатр Джон Мани пишет: "Роль пола не устанавливается при рождении, но строится кумулятивно через опыт, сталкиваясь и проходя через причинное и непланируемое обучение, через точные инструкции и внушения и через спонтанное складывание двух с двумя, чтобы получить четыре, а иногда, ошибочно, пять". В тех случаях, когда ребенка уже с пеленок родители воспитывают в противоположном поле, то есть создавая у него убеждение, что он существо другого пола, то именно в принадлежности к этому (а не биологическому) полу и формируется его половое самосознание.

Такие случаи, когда родители воспитывают ребенка в противоположном поле, действительно бывают. В этих случаях патология не достигает уровня "ядерного" варианта транссексуализма, это более мягкие его формы, которые сближаются по своим проявлениям с трансформацией половой роли и могут проявляться стремлением играть роль противоположного пола, овладевать профессиями, присущими другому полу, но не сопровождаются стремлением изменить свой биологический пол. Воспитанные с детства как мальчики и проявляющие черты поведения мальчиков, девочки избирают "мужские" профессии, опекают и защищают более слабых, проявляют решительность, бесстрашие и другие черты характера, присущие мужчинам, и гораздо лучше чувствуют себя в такой роли, чем в навязываемой им женской роли.

Г.Каплан и Б.Сэдок считают, что хотя большое значение имеют биологические факторы, но основным фактором в принятии соответствующего данному человеку пола является обучение. Субъект может отождествлять себя со своим собственным полом и все-таки заимствовать платья, прическу и другие атрибуты противоположного пола. Или же субъект может отождествлять себя с противоположным полом и все же вести себя во многом так, как это характерно для его собственного пола.

Американские психиатры считают, что нарушения половой идентификации могут возникнуть и после физического или сексуального насилия — это чаше всего свойственно девочкам, когда после насилия они испытывают отвращение к себе и своему полу. Хотя половое самосознание складывается у ребенка довольно рано (до 5 лет, а чаще раньше), но, возможно, такие случаи бывают.