Однако продолжающий обостряться польско-украинский конфликт в волынском регионе в конечном счете приводит командование Армии Крайовой к осознанию необходимости защиты волынских поляков. Обращение к активным формам борьбы против украинских националистов, организация польских отрядов самообороны означали для АК переход от конспиративной к вооруженной деятельности и смещение вектора политики ее Главного командования с организации подпольных структур государственного аппарата на оккупированных землях к руководству самообороной и партизанским движением поляков. Конечно, это не означало отказа от борьбы за восстановление Польского государства в довоенных границах на востоке, а было вынужденной реакцией на сложившуюся на волынских землях обстановку. Активизации польского пролондонского подполья в организации самообороны способствовал и внешний фактор, а именно победа Красной Армии в Сталинградской битве и ее переход в стратегическое наступление. С этого момента все более реальной становилась возможность освобождения Польши от немецких захватчиков Советским Союзом, что грозило потерей восточных кресов и отстранением от власти польского правительства в эмиграции.

В июне 1943 года началась реорганизация волынского округа АК под руководством его коменданта полковника К. Бомбиньского («Любонь»). По планам командования польская самооборона должна была состоять из двух основных элементов: баз самообороны и летучих партизанских отрядов, поддерживающих связь с защитниками польских «цитаделей» Сильные отряды самообороны, называемые «пляцувками», создавались на базе нескольких сел с большой концентрацией польского населения, вокруг которых возводился ряд укреплений, окопов и блиндажей. Из сельских ячеек АК, а также из остатков разгромленных оуновцами групп самообороны формировались специальные отряды для охраны этих баз, а также партизанские отряды для помощи им. Лучшими были партизанские отряды под командованием капитана В. Коханского («Бомба», «Вуек») (создан из защитников с. Старая-Гута Костопольского р-на), Я. Матушинского («Быстрый») и Я. Вышомирского («Мирек») (создан из участников самообороны с. Билин Владимирского р-на). В июле 1943 года, в самый разгар карательных акций украинских националистов против поляков, полковник К. Бомбиньский распорядился увеличить количество партизанских отрядов для поддержки баз самообороны. Хотя это были небольшие формирования, порядка нескольких десятков человек, они повышали эффективность польского противостояния в тех районах, где наиболее активно действовали бандеровцы. В Луцком, Ковельском, Ровенском и Костопольском районах были сформированы партизанские отряды.

К сожалению, точно не известно, сколько баз польской самообороны было организовано за время «Волынской резни» Польские исследователи полагают, что их было около 300. 129 из них продержались до освобождения Волыни Красной армией, 49 были разгромлены украинскими националистами. Центрами самых крупных и крепких баз стали польские поселения в Пшебраже, Гуте-Степаньской, Панской-Долине, Рожище, Житине, Рыбче, Млынове, Шумске, Старой-Гуте, Былине, Засмыках и Купичове. Они просуществовали до самого прихода советских войск на волынские земли и в самое тяжелое время могли принять под охрану до 30 тысяч поляков, спасавшихся от кровавых расправ.

Реалии войны и ход событий на основных фронтах возымели большее влияние на выбор местных поляков, с какими партизанами им выгоднее было сотрудничать. Это не значит, что волынские поляки отказались от участия в борьбе с фашистами в рядах Армии Крайовой.