Наконец, стала известна судьба исчезнувшего два года назад «Архистратига Михаила» под командой Олесова. Корабль с опозданием прибыл зимовать на Уналашку, а весной шторма и поломка мачты не позволили ему покинуть остров. Пришлось зимовать. К Шелихову отправились на шлюпке 30 человек, но штормом их отнесло к берегу американского материка, где и прошло шесть недель. Одиннадцать человек погибли, остальных спас отряд промышленника Евстрата Даларова.

Тем временем Шелихов распорядился построить крепости на мысе Св. Ильи, а также в Чугацком заливе и на острове Афогнак. И составить опись побережья. Для утверждения принадлежности земель России он велел «ставить кресты и закапывать в землю обломки горшечные, кору берёзовую и уголья».

Сам Шелихов шёл с островов на «Трёх Святителях» в Охотск, а правителем русских поселений на американском берегу, где находилось 163 промышленника, и Алеутских островах оставил енисейского купца Константина Самойлова. Он наказал ему «поступать расселением российских артелей для примирения американцев в прославлении Российского государства на изъяснённой земле Америке и Калифорнии до 40-х градусов (северной широты)».

По пути к Камчатке Шелихов встретил «Михаила» и приказал вести судно на остров Афогнак, сам же пошёл вдоль Алеутских островов. Согласившиеся плыть в Россию алеуты исполняли обязанности матросов (почти вся команда болела цингой). Шелихов достиг Камчатки в устье реки Большой и стал на якорь у посёлка Большерецк; судно сорвало с якоря, когда он был на берегу. «Трёх Святителей» унесло в море, и корабль пошёл в Охотск без командира, а Шелихов на байдарке доплыл до Петропавловска.

В Охотск Шелихов прибыл с оленьим караваном через север Камчатки, а потом — вдоль побережья Охотского моря. Только 27 января 1787 года он, наконец, достиг Охотска, там встретился с женой и детьми, остававшимися на галиоте «Три Святителя», а ещё через полтора месяца добрался до Иркутска. Дальнейший путь лежал в Петербург, где Шелихов собирался официально закрепить освоенные им американские земли.

Российско-Американская компания

Вместе с купцом Голиковым Шелихов обратился к Екатерине II с прошением: 20 лет монопольно промышлять на Алеутских островах и побережье Северо-Западной Америки. Купцы просили от государства беспроцентную ссуду 200 тысяч рублей. С нетерпением ждали они ответа из Зимнего дворца. Екатерина II внимательно ознакомилась с представленными ей бумагами. Но реакция её была отрицательной. «В казне теперь нет денег никаких», — ответила она на просьбу о займе 200 тысяч рублей. Императрице не понравилось также, что купцы хотели монополизировать торговлю: «...исключительная торговля противное моим правилам». Но главное — она не одобрила саму идею приобретения Россией новых владений в Тихом океане: «Многое распространение в Тихом море не принесёт твёрдых польз. Торговать дело иное, а владеть дело другое».

Екатерина II отказала и в праве использовать на службе Американской компании морских офицеров и артиллерии. Шёл 1788 год. Императрица словно предвидела, что через 79 лет русское правительство добровольно откажется от американских владений, ссылаясь на то, что удержать их нелегко.

Но купцы-просители всё же были одарены монаршими наградами: за свои труды на пользу отечества они получили шпаги, медали и почётные грамоты...

Шелихов возвратился в Иркутск и позже в Охотск.

Он решил продолжать своё дело и без царской ссуды.