К началу XV века Пражский университет стал одним из крупнейших центров средневекового просвещения не только в Чехии, но и во всей Европе. В Праге было более двух тысяч учащихся. Число преподавателей доходило до трехсот. Так как в руководящие университетские органы выдвигалось равное количество лиц от каждой «нации», руководство университетом оказалось в руках немцев и других иностранцев. Это вызвало острые внутренние противоречия. Магистры-чехи, опираясь на поддержку части студентов, вели борьбу против иноземного засилья в академической среде. Борьба внутри университета была составной частью борьбы чехов за свою национальную культуру.

Чехия вместе с Силезией и Верхними Лужицами после смерти Карла досталась его сыну Вацлаву IV (1378—1419). Он являлся до 1400 года одновременно германским императором. Другой же сын Карла I получил Бранденбург и стал венгерским королем. Позже он был избран германским императором. Этим наследникам Карла и пришлось столкнуться с революционным движением чешского народа — Великой крестьянской войной.

Крестьянство Чехии подвергалось жестокой феодальной эксплуатации. Оно и явилось основной силой движения. Важное значение в деле общей борьбы различных слоев народа имело чешское бюргерство. Оно было возмущено произволом немецких правителей городов и поведением онемеченных чешских панов, которые поддерживали посягательства германского императора на независимость Чехии. Мелкое и среднее дворянство примыкало к бюргерам. Оно в свою очередь было недовольно крупными феодалами, которые грабили его и бесцеремонно обращались с ним. Национальный и социальный конфликт осложнялся антицерковной борьбой, в которой на первых порах принимали участие все сословия феодальной Чехии. Антифеодальная борьба быстро переросла в национально-освободительную. Знаменем этой борьбы сделалась Реформация — движение за ликвидацию церковных богатств и против политического влияния католической церкви.

Во второй половине XIV века проповедь реформационных идей пользовалась большим успехом среди чешского бюргерства. В шестидесятых годах этого века с критикой духовенства выступил в Праге монах-августинец Конрад Вальдгаузер. Приблизительно в то же время выступил Ян Милич. Он обличал пороки прелатов и клеймил духовенство за его богатство и роскошь. После смерти Яна Милича проповедь реформационных идей подхватил Матвей из Янова. Он окончил Пражский университет, а жил то в Париже, то в Праге. По этой причине он известен под именем Парижского и Пражского. Матвей призывал вернуться к простоте нравов первоначального христианства. Он требовал ликвидации всех монастырей и заявлял, что имения церкви должны принадлежать бедноте. Сословия феодального общества Матвей считал изобретением дьявола. По его мнению, в мире должно было быть установлено всеобщее равенство.

У Матвея были свои ученики и последователи. Один из них выдвинул требование ввести причащение всех мирян, а не только лиц духовного звания, «под обоими видами», то есть причащение всех верующих хлебом и вином. Дело в том, что один из догматов католической церкви утверждал, что только духовенство может причащаться «под обоими видами», светские же люди должны причащаться лишь хлебом, а не вином, то есть вкушать лишь «тело христово», но не его «кровь».

Значение этого догмата состояло в том, что он служил обоснованием привилегированного состояния духовенства и его выделения из мирян.

Острая борьба, которая развернулась в Пражском университете между чешскими и немецкими магистрами, оказалась сразу же связанной с первыми выступлениями чешских реформаторов. Наряду с их идеями в Пражском университете стало распространяться близкое им учение английского реформатора Джона Виклефа. Чешских магистров и студентов в богословских и философских сочинениях Виклефа привлекали критика католического духовенства и отрицание его прав на богатства и земельную собственность.