В этот момент на сцену и выступили скифы. Их царь первоначально был призван на помощь ассирийцами. Но, двинувшись навстречу Набопаласару, он изменил намерения и перешёл на сторону вавилонян. В результате скифо-армянское войско (армянские предания помнят как участника осады Ниневии царя Паруйра, сына Скайорди) присоединилось к вавилонянам. Произошло это ещё до соединения Набопаласара с мидянами — замысел Синшарриишкуна состоял в том, чтобы скифский союзник разбил врагов поодиночке. Однако теперь многолетнему союзу скифов с Ассирией настал конец. Накануне самого падения Ассирийской державы скифы вновь предпочли сильнейшую сторону — усилив последнюю ещё более.

Имя предводителя скифов неизвестно. Вряд ли это был по-прежнему Мадий. Скорее речь о Спаргапифе, которого Геродот упоминает как предка верховных скифских царей VI в. до н. э., или о его сыне Лике. Время их жизни рассчитывается весьма приблизительно. Во всяком случае, смерть вероятного полуассирийца Мадия и переход власти к боковой ветви царского рода могли сыграть роль в перемене политики.

В августе 612 г. до н. э. Ниневия была взята. Синшарриишкун сжёг себя в собственном дворце. Город отдали на поток и разграбление, после чего разрушили. Население или рассеялось, или было истреблено и уведено в рабство. Возможно, что часть ассирийских земель досталась скифам. Однако война не окончилась. Ассирийский полководец Ашшурубалит, провозгласив себя царём, при помощи египтян удерживал Сирию. На его резиденцию Харран выступило вавилонское войско. В одиночку Набопаласару справиться не удалось. Харран он захватил только в 610 г. до н. э. при помощи скифов. На следующий год мидяне помогли ему удержать город, отразив большое египетско-ассирийское войско. Ашшурубалит, видимо, пал в бою. С Ассирией было, наконец, покончено.

В 609–607 гг. до н. э. вавилоняне и мидийцы при поддержке скифов обрушились на Урарту, царь которого Эримена до последнего признавал себя вассалом Ассирии. Страна была опустошена и признала зависимость то ли от мидян, то ли от скифов — или от тех и других. Большинство крепостей, служивших оплотами для остатков былой урартрийской мощи, погибло. Столица царства была перенесена из древней Тушпы у озера Ван на северную окраину, в мощную крепость Тейшебаини близ современного Еревана.

В 605 г. до н. э. умер Набопаласар. Скифы сохранили союз с новым вавилонским царём Навуходоносором. С севера союзники угрожали Египту и зависимой от него со времён Ассирийской войны Иудее. Угроза нашествия вынудила иудейского царя Иоакима признать в 604 г. до н. э. власть Навуходоносора. В 601 г. до н. э. скифы, видимо, приняли участие в походе Навуходоносора на Египет, в котором вавилоняне были отражены фараоном Нехо.

С 596 г. до н. э. начали обостряться отношения между Вавилоном и Мидией. В новом конфликте скифы приняли сторону мидян, служивших им одним из основных источников дохода. Возможно, впрочем, что Киаксар намеренно втянул скифов в военные действия, уже собираясь избавиться от дорогостоящих союзников. В 594 г. до н. э. скифы вместе с урартрийцами и маннеями угрожали Вавилонии с севера. Навуходоносору пришлось отражать вражеские отряды от самых стен Вавилона. Однако большой войны не произошло. Как раз в это время Киаксар расправился с верхушкой скифов. По словам Геродота, «Киаксар и мидийцы пригласили большую часть из них и, напоив допьяна, перебили». Истреблено было, конечно, не всё скифское войско (и едва ли «большая часть»), а предводители во главе с царём — видимо, Ликом, сыном Спаргапифа.