Конечно же, изуверский обряд не увенчался успехом, однако ответственность за колдовской замысел была возложена на двух докторов-евреев (один из них на момент следствия уже умер, а другой жил в Саморе, довольно далеко от Толедо). Примечательно, что первого не осудили посмертно, как это было принято в инквизиторской практике, а второго даже не стали искать, что дает отличный повод считать дело полностью сфабрикованным. Не было найдено и следов жертвы. Так сказать, «за давностью событий» этот очень важный вопрос так и оставили открытым. Было лишь объявлено, что в тот год в окрестностях Ла-Гуардии пропало несколько детей…

Двадцать седьмого августа 1490 года Томас де Торквемада отдал приказ доставить обвиняемых в Авилу для суда. Для ведения процесса он назначил инквизиторов Педро де Виллада, Хуана Лопеса де Сигаль и брата Фернандо де Санто-Доминго.

Шестнадцатого ноября 1491 года основных обвиняемых (восемь человек) сожгли на костре в городе Авила, а их жертва была провозглашена святой.

Считается, что это дело, получившее в исторической литературе название «кровавый навет», было начато по специальному распоряжению генерального инквизитора Торквемады. Якобы сам Торквемада был готов заняться им лично, «если бы не другие неотложные обязанности», в результате чего он поручил его трем другим инквизиторам.

Большинство историков сходятся во мнении, что вся эта история со «святым дитя из Ла-Гуардии» была плодом политической мысли Томаса де Торквемада: генеральный инквизитор якобы задумал использовать безотказное средство воздействия на общественное мнение. Он будто бы хотел оправдать деятельность инквизиции, придав ей роль защитника истинных христиан от коварства «новых христиан», действовавших заодно со своими бывшими единоверцами. Якобы все это было задумано Торквемадой для того, чтобы оправдать грядущее изгнание евреев — в глазах как всего общества, так и, возможно, самих Католических королей. Однако ничему этому нет документальных подтверждений. Более того, например, в декрете об изгнании евреев, изданном Изабеллой и Фердинандом всего через несколько месяцев после завершения дела о ритуальном убийстве «святого младенца из Ла-Гуардии», оно вовсе не упоминалось среди еврейских прегрешений.

А вот мнение об этом деле исследователя испанского еврейства Ицхака Бера: «Ясно одно: убийство в ритуальных или магических целях — преступление, абсолютно несовместимое с установками еврея… Совершенно очевидно, что обвинение выросло из антисемитской литературы предыдущего века, а не из признаний арестованных… Нельзя даже допустить мысли о том, чтобы евреи стали использовать христианские культовые предметы или согласились на участие „конверсос“, которых не считали иудеями и которые не были даже обрезаны… Нет ни тени сомнения: обвинения в распятии ребенка и колдовстве были изобретениями антисемитской пропаганды».

Следует отметить, что подобная точка зрения была и продолжает быть канонической для большинства исследователей.

В частности, С. Г. Лозинский в своей «Истории инквизиции в Испании» пишет: «Широкое развитие инквизиции сделалось возможным в Испании лишь благодаря долгой и упорной церковной пропаганде.