Год спустя Могилевич сел на три года за нарушение закона о валютных операциях - его взяли на скупке золотых монет царской чеканки. И позднее он снова объяснял свой арест политическими мотивами, а именно - знакомством с сыном первого секретаря ЦК КПУ Владимира Щербицкого:

«…У нас была очень близкая дружба, но его папа при помощи всех возможных спецслужб ограждал своего сына от такого общения. Подвернулся повод, и меня быстренько посадили… Папа любил ему повторять: «Смотри, сынок, сионисты до хорошего не доведут».

Между тем «политическая непруха» для Могилевича продолжалась. Буквально через год после освобождения он снова оказался за решеткой. На этот раз якобы за то, что помог купить другу, отъезжавшему на ПМЖ в Израиль, две с половиной тысячи долларов. Впрочем, адвокат Могилевича сумел убедить суд в том, что его подзащитный просто хотел кинуть покупателя валюты.

«…История похожа на детективный роман… В нем участвовал министр обороны республики Конго, работники правоохранительных органов… Это был легкий детектив, который закончился четырьмя годами лишения свободы. Статья традиционная, когда хотят упрятать невинного человека за решетку, - мошенничество».

По версии же сотрудников правоохранительных органов, Могилевич кинул мясника Юхимовича на пятьдесят три тысячи рублей при покупке валюты у «негра-дипломата». После случившегося Юхимович пришел в бар, где сидели «разводяги» и открыл огонь из двух пистолетов. Деньги ему были возвращены, и, кстати, позже он стал… деловым партнером Могилевича в Киеве. Как говорил известный российский политик Сергей Глазьев: «Ничто так не объединяет людей, как совершенное вместе преступление».

Освободившись во второй раз, Могилевич, вопреки своей «политической неблагонадежности», сумел весьма неплохо устроиться - работал главным художником, главным инженером, главным технологом, начальником цеха. Короче, Везде - главным. Возможно, именно это слово в дальнейшем и стало его жизненным кредо.

Через некоторое время Могилевичу наскучил Киев, и он перебрался в Москву, где с началом перестройки занялся бизнесом, позднее объясняя это свое решение так: «Я со своими друзьями попытался помочь государству перейти к новой экономической модели. Мы сразу зарегистрировали кооператив, совместное предприятие…» Среди этих друзей называют Сергея Михайлова (Михась), Виктора Аверина (Авера) и Тимофеева (Сильвестра). Здесь мудрому - достаточно,

Созданная друзьями фирма «Арбат-Интернэшнл» занималась перевозкой грузов, арендуя суда в Черноморском пароходстве. Другим направлением бизнеса стало развитие сети… платных туалетов на вокзалах от фирмы «Внуково-!». В дальнейшем такая же была открыта и в Киеве («Внуково-2»). А некоторое время спустя на Ченнел-Айлендз (Нормандские острова) был зарегистрирован одноименный офшор, через который осуществлялись сделки с нефтью и газом.

В 1989 году Могилевич женился на венгерской гражданке Каталин Папп и год спустя переехал в Будапешт. Отныне он гражданин Венгрии, а с 1992 года - ещё и гражданин Израиля.

В венгерской столице Могилевич поставил свой бизнес на широкую ногу в 1991 - 1992 годах он стал владельцем в Будапеште дискотеки «Black and white», позднее открыв ещё несколько аналогичных заведений в паре-тройке столиц Восточной Европы, а также прикупил по случаю венгерские оружейный завод и предприятие по выпуску магнитов.

Американская газета «Слово» со ссылкой на отчет ФБР сообщала: «Семен Могилевич имеет долю в двух фирмах, находящихся в Венгрии: «Magnex 2000 R» - изготовление магнитов, и «Digep General Machine Works», занимающейся производством ремней для артиллерии, огнестрельного оборудования и строительного раствора.