Для осуждения их достаточно было двух свидетельств, если только они не слишком противоречили друг другу. Обращение с подозреваемыми определялось инструкциями Торквемады и других руководителей инквизиции.

Страстное желание монархов сделать всю страну католической и пополнить казну за счет конфискаций, как и желание инквизиторов выявить побольше действительных или мнимых еретиков, приводило к тому, что инквизиторы чинили произвол в отношении несчастных, попавших в их руки. У людей было мало надежд освободиться, и нередко они надеялись только избежать истязаний и мучительной смерти. Часто подозреваемых арестовывали по ночам. Фамильяры (полицейские инквизиторы) стучали в двери и требовали, чтобы их впустили (иначе они врывались в дома, применив силу). Арестованному предлагали немедленно собираться. Эти приемы, как и подобные, применявшиеся в европейских странах в XX в., должны были запугать население. Фамильяры старались производить при задержании как можно меньше шума. Если задержанный начинал кричать и мог разбудить соседей, ему затыкали рот кляпом.

Попав в Святую палату, пленник подвергался допросам. При этом инквизиторы делали все, чтобы воздействовать на психику человека. Комната обычно была задрапирована черной материей, сквозь окна не проникало света. На столе, покрытом черным бархатом, стояло распятие и шесть горящих свечей, а также лежала Библия. У стола стояла кафедра, за которой сидел секретарь, зачитывавший список преступлений, вменяемых задержанному. За столом сидели инквизиторы в белых монашеских одеждах с черными клобуками. Позади пленника в ряд выстраивалась стража, доставившая его в здание инквизиции. Старший инквизитор обычно некоторое время не обращал внимания на арестованного, делая вид, что поглощен изучением бумаг, лежавших на столе. Это делалось по инструкции, а также с целью увеличить тревогу и растерянность пленника. Потом секретарь задавал вопросы о его имени, адресе и т. п., а старший инквизитор, отложив бумаги, спрашивал, знает ли подозреваемый, за что он арестован. Бедняга отвечал, что не знает за собой никакой вины, после чего инквизитор снова углублялся в чтение. Затем у несчастное допытывались, есть ли у него враги, как часто он исповедуется, какого он прихода, кто духовник и когда подозреваемый последний раз был на исповеди.

Инквизиторов предупреждали, что страх, растерянность, слезы и жалобы жертвы не должны производить на них впечатления. Им напоминали, что не следует забывать о коварстве еретиков. Разве они не притворялись католиками, тайно предаваясь ереси? Инквизиторам следовало помнить, что осуждение одного еретика может означать спасение для тысяч людей, так как многие еретики увлекали за собой других на путь греха и противодействия Господу и церкви.

Цель допросов состояла в том, чтобы заставить задержанного покаяться, а также, по возможности, обвинить в ереси своих родственников и знакомых.

Если, однако, человек упорно молчал в ответ на задаваемые вопросы, то применялась иная тактика. Инквизитор делал вид, что сочувствует пленнику, говорил, что не желает ему вреда, что он смотрит на пленника как на заблудшее дитя и желает, чтобы он возвратился на путь истинный. Для этого необходимо покаяться, и тогда узник снимет бремя греха со своей души, почувствует облегчение и получит прощение церкви. Но искреннее раскаяние предполагает ненависть к ереси. Поэтому покаявшийся должен назвать имена других людей, совершающих грех втайне. Покаявшиеся должны и другим дать возможность покаяться. Этот прием действовал достаточно успешно. Многие попадались на эту уловку, и новые узники появлялись в тюрьмах инквизиции. Если, однако, человек продолжал настаивать на собственной невиновности, то применялись более изощренные приемы. Например, человека могли поместить в более удобную камеру, чем раньше, и допускать к нему избранных посетителей, которые должны были вести с заключенным доверительные беседы и уговаривать покаяться, после чего он получит мягкое наказание.