Главная военная прокуратура заявила, что обвинения Литвиненко в адрес руководства ФСБ не подтвердились. А вот коллеги-чекисты на него сильно обиделись. Предательства корпоративных интересов на Лубянке не прощают. Подполковника уволили. Припомнили старые дела. Литвиненко и его приятелей по расформированному седьмому отделу обвинили в том, что они кого-то избили при обыске, на кого-то давили, добиваясь нужных показаний.

Березовский нашел Литвиненко работу – взял его в аппарат исполнительного секретариата СНГ советником отдела по вопросам безопасности Департамента военного сотрудничества и безопасности. Но это подполковника не спасло. Двадцать пятого марта 1999 года его арестовали по обвинению в превышении полномочий с применением насилия при проведении следственных действий. Задержали Александра Вальтеровича бывшие сослуживцы. Литвиненко уверял, что по дороге в Лефортово один из них повторял: «Зачем ты полез на телевидение? Попер против системы? Тебя же люди предупреждали. Сидел бы тихо».

В ноябре военный суд признал Литвиненко невиновным. Но сотрудники ФСБ вновь его арестовали. Двадцать шестого ноября 1999 года в зале суда – невиданное дело! – появились вооруженные люди и увели Литвиненко, несмотря на возмущение судьи. Шестнадцатого декабря суд освободил его из-под стражи под подписку о невыезде.

Осенью 2000 года бывший подполковник Литвиненко с семьей покинул Россию и через Турцию перебрался в Англию, где получил политическое убежище. Летом 2002 года его заочно судили в России и приговорили к трем с половиной годам тюремного заключения. Приговор был воспринят как политическая месть. В октябре Литвиненко, не отказываясь от российского гражданства, получил британское подданство.

С помощью разных журналистов написал несколько книг – «ФСБ взрывает Россию» (о причастности госбезопасности к взрыву домов в 1999 году), «Лубянская преступная группировка», «Вызываю себя на допрос». Многие утверждения автора вызывали серьезные сомнения, поскольку не подтверждались фактами, но рисовали пугающую картину тесного сращивания спецслужб с криминальными структурами.

Отношение к самому Литвиненко и к его словам изменилось после того, как он был убит.

Первого ноября 2006 года он встретился в Лондоне с бывшими коллегами по ведомству госбезопасности – Андреем Луговым, Дмитрием Ковтуном и Вячеславом Соколенко. В тот же день Литвиненко почувствовал себя плохо. Жена отвезла его в больницу. Состояние Литвиненко быстро ухудшалось. Его перевели в университетскую клинику, где предположили, что он отравлен каким-то радиоактивным веществом. Но никак не удавалось установить, каким именно.

Его фотографии, сделанные на больничной койке, обошли весь мир. Они не только запечатлели невероятные страдания Литвиненко, но и стали свидетельством жестокости тех, кто выбрал такой способ убийства, кто хотел не просто уничтожить человека, но и заставить его мучиться.

Поздней ночью 23 ноября 2006 года бывший подполковник скончался от острой сердечной недостаточности. И лишь за три часа до смерти врачам удалось обнаружить в его организме следы радиоактивного вещества полоний-210. Стала ясна причина смерти. Если бы полоний не нашли, кончина Литвиненко не была бы признана убийством, не имелось бы оснований и для возбуждения уголовного дела. Возможно, злоумышленники на это и рассчитывали. Вероятно, это первый случай умерщвления человека с помощью полония, что свидетельствует об изощренном уме убийцы и его неограниченных возможностях.

В своем предсмертном заявлении Александр Литвиненко обвинил в попытке убить его президента России Владимира Путина. Британские следователи сочли исполнителем Андрея Лугового. Министерство внутренних дел Великобритании попросило Генеральную прокуратуру России выдать им подозреваемого для проведения следствия.