11 февраля 1304 г. папа Бенедикт XI разрешил торжественное почитание стигматов св. Франциска Ассизского. Он также подтвердил законность деятельности ордена сервитов, живущих по уставу св. Августина. Если папу Бенедикта VIII можно справедливо назвать великим канонистом, то Бенедикт XI, являющийся автором богословских произведений, безусловно, заслуживает внимание как выдающийся папа-теолог. Естественно, все богословские произведения написаны им еще до начала его понтификата. Их можно условно разделить на две части — это комментарии на различные библейские тексты (Книгу Иова, Псалмы, Евангелие от Матфея и Откровение), а также проповеди к различным церковным праздникам. Ему также принадлежит трактат, посвященный церковным нравам.

Во времена Бенедикта XI еще была жива память о славных временах крестовых походов, и папа с рвением занимался вопросами, связанными с экспедицией против турок, но не успел ничего предпринять для ее осуществления. Слишком коротким оказался его понтификат и для решения иных проблем, с которыми он столкнулся и которые должен был решать. Это, прежде всего, политический конфликт между неаполитанскими анжуйцами и арагонцами из-за Сицилии; связанный с гвельфами кризис во Флоренции. В церковном плане — вопрос о разделении францисканцев. В мае 1304 г. Бенедикт XI из-за всё тлеющего конфликта с родом Колонна, бывшего очень влиятельным в Риме, вынужден был перебраться в Перуджу, где и встретил свою смерть.

В числе особенностей характера Филиппа Красивого особенно выделялась мстительность. Он отлично понял жест папы, даровавшего ему прощение. У него уже имелся удачный опыт устранения неудобных понтификов, которым досадно было бы не воспользоваться.

Известно, что Бенедикт скончался, отведав свежих фиг, поднесенных ему во время трапезы в доминиканском монастыре. В качестве дарителей называли некую даму под вуалью или молодого монаха, презентовавших папе аппетитные винные ягоды. Инициатором этого злодеяния (если таковое вообще имело место) молва упорно считала Гильома Ногаре. Но это всего лишь историческая версия, не имеющая конкретных доказательств. По другой версии, тоже криминальной, фиги были отравлены по наущению флорентийцев.

Понтификат Бенедикта XI продолжался только восемь месяцев и пять дней. Человек вполне здоровый и еще не старый, он мечтал о всеобщем примирении, установлении царства справедливости и отвоевании у неверных христианских святынь. Смерть не только положила конец его планам, но едва не стала крушением самого папства.

Папа погребен в кафедральном соборе Перуджи, рядом с алтарем, и ему сооружено великолепное мраморное надгробие.

После смерти Бенедикта на его могиле начали совершаться многочисленные чудеса, и почивший папа стал почитаться народом как святой. Официальное же его причисление к лику блаженных совершил только папа Климент XII. Это произошло 24 апреля 1736 г., и с этого времени народное почитание было официально утверждено римским первосвященником.

Бенедикту посвящен ряд исторических трудов, в которых вопрос о том, был ли он более знаменит своей ученостью или же своей святостью, остается открытым.

Бенедикт XI оказался последним римским понтификом, чей престол находился в Риме. Предшествующие папы часто вступали в конфликт с римлянами, покидали Вечный город, проклиная неблагодарную чернь или коварных врагов; некоторые предпочитали более спокойные и уютные города, а другие за весь свой понтификат так ни разу и не побывали в Риме и не поднялись на римскую кафедру. Но Святой Престол всегда был и оставался в Вечном городе. Люди всех наций, занимая кафедру св. Петра и беря в руки посох наместника Иисуса Христа, забывали о своей родине, чтобы стать пастырями всех народов; они видели перед собой только Рим и весь мир.

Падение Бонифация VIII увлекло за собой папство. То, что не удалось совершить Гогенштауфенам, дерзнул и смог осуществить Филипп Французский.

Король Филипп теперь мог ставить угодных ему пап.