Он нашел такого человека в лице Бернара, архиепископа Бордоского, отличавшегося тщеславием и амбициозностью. Король Филипп встретился с архиепископом и обещал, что поможет ему сделаться папой, если тот выполнит некоторые условия короля. Бернар, перед которым открылась перспектива поддержки от такого могущественного монарха, с радостью согласился. Правда, одним из условий являлся отказ от почитания памяти папы Бонифация, а это не было легким делом. Еще одно условие, на котором король настаивал, он до поры сохранил в секрете. Филипп оставил у себя заложниками брата и двух племянников будущего папы, и они расстались. Через несколько недель архиепископ стал папой Климентом V. Филипп же теперь становился самым могущественным человеком в Европе. Тот, кто прежде мог бросить ему вызов, теперь находился под его контролем. Более того, новый папа перенес резиденцию из Рима в Авиньон, который хотя и был папским владением, но находился во Франции, под контролем короля. Этот период (около 60 лет) прозвали «авиньонским пленением пап».

Вскоре после этого французский король сообщил папе о последнем условии — о необходимости упразднить орден тамплиеров (рыцарей храма). Новый папа был поражен: он не понимал, чем тамплиеры не угодили королю Франции. Правда, они не поддержали его против Бонифация, но едва ли это было достаточным основанием для таких суровых мер. Между тем Филиппу были очень нужны деньги. Он знал, что этот орден располагает сокровищами огромной ценности, тем более что сам пользовался убежищем в замке тамплиеров во время беспорядков в Париже в 1206 г. Войны, которые он вел, истощили казну, а богатства тамплиеров могли бы поправить дело.

Орден рыцарей храма сильно изменился со времени своего основания на Святой земле в Иерусалимском королевстве времен первых крестовых походов, около 1119 г. Уже к концу XII века он располагал огромными богатствами во всех христианских странах, а через сто лет его мощь и богатства еще возросли. Король Филипп был намерен завладеть всем этим достоянием, а папе Клименту пришлось теперь выполнять волю того, кому он был обязан избранием. Папа и король вызвали в Париж великого магистра ордена Жака де Моле, будто бы для того, чтобы обсудить планы нового крестового похода. Тогда же Филипп распространил слухи о преступных пороках, которым будто бы предались тамплиеры. Сам же король делал вид, что даже не слышал ничего об этом, и де Моле был уверен, что пользуется благосклонностью короля, тем более что был крестным отцом одного из королевских детей. Хитрый Филипп подождал еще какое-то время, а затем снова встретился с папой, и они обсудили тревожные слухи о тамплиерах, после чего король заявил, что это надо расследовать. Не трудно было получить доказательства их вины, и в результате великий магистр был арестован, как и ведущие тамплиеры по всей Франции. Начались пытки и казни. Клименту должно было быть стыдно за такое обращение с людьми, которые любили богатство и роскошь, но никогда не были врагами Рима и не были виновны в тех нелепостях, которые ставились им в вину.

Де Моле и два других руководителя ордена были сожжены 11 марта 1314 г. Под пытками они сделали нужные признания, но, когда их повели на казнь, отказались от признаний и де Моле, говорят, заявил: «Бог отомстит за нашу гибель». Так как папа скончался уже в апреле, а король Филипп — через восемь месяцев после казни великого магистра, появились слухи, что их смерть связана с его проклятием.

Добиваясь богатств тамплиеров, король Филипп одновременно установил власть французских королей над папами.

В 1334 г. Филипп VI подтвердил привилегии инквизиции, при условии, что она будет выполнять волю французской короны. Жестокие преследования еретиков и заподозренных в ереси продолжались. При Франциске I произошла кровавая расправа с вальденсами, но и прежде были казни еретиков.