Новый папа немедленно восстановил в силе постановления Стефана VI и потребовал повторного назначения епископов, поставленных Формозом. Поскольку те, в свою очередь, также принимали какие-то решения относительно священников более низкого ранга, это привело к хаосу в церковной иерархии.

Позже постановления Сергия были аннулированы, а правление Формоза признано полностью законным.

Церковные историографы во главе с Баронием предают проклятию память о Сергии III как о чудовище. Конечно, напрасно бьшо бы искать в нем апостольские добродетели; однако он в самые бурные времена оставался папой целых семь лет, и нельзя не признать за ним, по крайней мере, силы. Некоторые из грамот Сергия свидетельствуют, что он заботился о подчиненных ему церковных учреждениях. Буллой 906 г. он подарил много имений одному из епископств, где почти все жители были перебиты сарацинами. Другим распоряжением аббатисе монастыря Corasmus Евфимии, чьи владения также подверглись разорению от неверных, передавались большие земельные наделы. Такой человек, как Сергий III, который «наполнил папский хор любовницами и незаконнорожденными детьми, и превратил папский дворец в воровской притон», должен был, конечно, чувствовать надобность в представительстве монахинь; поэтому во спасение своей души он заказал ежедневно петь по сто раз «Господи помилуй!»

Существуют документы, которые удостоверяют, что Сергий восстановил много римских церквей, в т.ч. Латеранскую базилику Константина. Она была «сокровищницей реликвий, вторым Иерусалимом, главой и матерью христианских церквей». В ужасах междоусобий Латеранская базилика лежала грудой развалин, и горожане не переставали расхищать принесенные в дар римскими императорами произведения древнехристианского искусства. Римский народ требовал восстановления своего священного храма. Иоанну IX происходившие в Риме раздоры не дали возможности воссоздать эту городскую святыню. Сергий отстроил базилику и одарил ее новыми реликвиями. После Сергия III в течение двух веков почти все папы завещали хоронить себя уже не в базилике Св. Петра, а в Латеране. Здание постепенно наполнилось историческими памятниками и простояло почти 400 лет, пока не было уничтожено пожаром.

Будучи простым клириком, Сергий поддерживал партию патриотов. Теперь, заняв престол понтифика, он оказался свидетелем возвышения Беренгара Иврейского, который оставался признанным лидером прогерманской партии. За неимением иных предпочтений, папа решил пустить все на самотек, и Беренгар «получил корону и королевские регалии». С точки зрения благородства крови это был не худший выбор: мать Беренгара была дочерью Людовика Благочестивого, сына Карла Великого.

Престиж Сергия необыкновенно поднялся благодаря тому, что византийский император Лев VI (886–912), имея большие затруднения в вопросах брака и престолонаследия, обратился к нему относительно совета по поводу возможности четвертой женитьбы.

Лев не сомневался, что Сергий даст требуемую санкцию. Ни один понтифик, достойный папского трона, не упустил бы подобной возможности продемонстрировать свое влияние в делах Константинополя. Более того, Сергий крайне нуждался в военной помощи со стороны Византии в Южной Италии, где сарацины продолжали укреплять свое положение. Ответ Сергия оправдал все надежды императора и дал возможность Македонской династии (867–1056) просуществовать еще более 140 лет.

Практически все историки уверены, что пятнадцатилетняя Мароция, старшая дочь Теофилакта, стала любовницей папы III и родила от него сына, получившего впоследствии апостольский престол под именем Иоанна XI. Но папы уже придерживались целибата и законный союз любовников был невозможен.