Учение суннитов, или правоверных, было наиболее распространено среди мусульман. Идеологи господского суннитского движения право наследования Халифата основывали на иджма – согласии общины; происхождение будущего халифа от пророка не было обязательным. Заместитель Мухаммеда и повелитель правоверных избирался. Этот принцип основывали на сунне – воззрении, возникшем при образовании ислама. Сторонников этой доктрины стали называть суннитами. Против официального учения с оружием в руках выступили две группы – шииты и хариджиты.

Хариджиты – «повстанцы» выдвинули формулу: «Нет халифа кроме, как по воле Бога и по воле народа». Хариджиты не признавали законность провозглашения принципа наследственной власти халифа. Они объявили безусловный суверенитет мусульманской общины верующих. Халиф, или имам – духовный глава мусульман, обладающий и светской властью, – должен выбираться членами общины. Это может быть любой благочестивый, знающий догматы ислама мусульманин. Хариджиты отвергали представление суннитов и шиитов, что халиф обязательно должен быть из племени курейш, к которому принадлежал пророк Мухаммед. Хариджиты считали, что избравшая халифа община может в любой момент низложить и даже убить его, если его политика не устраивает общину. В 658 году в сражении при Нахраване, в Западном Иране, войска четвертого халифа Али разгромили хариджитов. Именно хариджит убил в 661 году Али на выходе из мечети.

Отряды хариджитов боролись против Омейядов, но более активно против Алидов. Они нападали даже на большие города, а после столкновения с войсками халифа уходили в болотистые и горные районы Ирана. Хариджитов поддерживали крестьяне и бедные горожане. С течением времени хариджиты стали очень нетерпимыми к мусульманам, не принимавшим их учения, что привело к значительному уменьшению поддержки населения. Идеологи хариджитов выдвинули лозунг, что дело каждого члена движения – постоянная борьба за осуществление их программы. Все другие, не поддерживающие хариджитов мусульмане, не имели права на спасение. Фанатичное крыло хариджитов воевало не только против власти халифа, но и против населения. У хариджитов появилось восемь группировок, в свою очередь распавшихся на более мелкие группы. При Аббасидах хариджитское движение полностью лишилось народной поддержки и быстро пошло на убыль.

Шиизм возник в первом столетии существования ислама. Первое время шииты составляли особую группу (по-арабски «шиа»), состоявшую из приверженцев Али, родственника Мухаммеда – посланника Аллаха. Они заявляли, что Али, родственник и зять Мухаммеда, имеет преимущественное право на верховную власть среди мусульман; после его смерти это право распространяется на его потомков. Шииты верили в то, что «божественная душа» может воплощаться в определенный период только в одном человеке. Этим человеком по верованиям шиитов мог быть только потомок пророка Мухаммеда, происходивший от Али и дочери Мухаммеда Фатимы. Этот избранный получил у шиитов название «имам», понимавших это слово, как «мессия».

Наследование халифата шииты основывали не на свободном выборе мусульманской общины, а на божественном праве, принадлежащем роду пророка Мухаммеда, «святой семье Али». Наследственный принцип передачи верховной власти они противопоставляли и захвату власти силой.