Примечательно, что самим «Учреждением для управления большой действующей армией» предусматривалось, что по меньшей мере три структурных отдела будут вести исследования по военной истории: Главный штаб, военный учёный комитет и военное топографическое бюро.

Отныне управление действующей армией было сосредоточено в четырёх отделах: Главном штабе и главных управлениях — инженерном, артиллерийском и интендантском. Соответственно были организованы корпусные и дивизионные штабы.

Часть первая — «О главнокомандующем, корпусных и дивизионных начальниках и их штабах» — определяла круг их прав и обязанностей, а также меру ответственности. Приказы и распоряжения главнокомандующего объявлялись обязательными как для армии, так и для гражданских чиновников и приравнивались к повелениям императора. Главнокомандующий назначал и смещал всех начальников, кроме командующих армиями, его власть распространялась и на членов императорской фамилии, если они находились в армии. Даже если сам император был в армии, верховная власть переходила к нему только в том случае, когда он издавал специальный указ об этом. Как видим, Александром I была учтена одна из причин поражения под Аустерлицем.

Однако и ответственность главнокомандующего соизмерялась с его властью. Он отвечал за состояние армии в целом, за порядок в войсках. В случае бездействия, равно как и за злоупотребление властью, он нёс ответственность вплоть до предания суду.

Часть вторая «Учреждения для управления большой действующей армией» определяла состав и обязанности чинов управления начальника Главного штаба. О самом начальнике Главного штаба говорилось, что он избирается из генералитета, причём «при выборе его предполагается, что с отличными природными и военными дарованиями, с нужною деятельностью имеет он основательные познания о правилах войны, о статистике земли, армиею занимаемой, и истории военных боевых действий, бывших в том краю, где война происходит.

Устанавливался круг обязанностей начальника Главного штаба, а также генерал-квартирмейстера, дежурного генерала, генерал-гевальдигера (начальника военной полиции), генерал-вагенмейстера (начальника армейского обоза), коменданта Главной квартиры и других военных чиновников. В том числе в корпусных и дивизионных штабах.

В «Учреждении для управления большой действующей армией» большое место занимали вопросы внутреннего распорядка и поддержания дисциплины. Например, деятельность военной полиции регламентировалась 28 параграфами, в которых излагались проступки и преступления, наказания и штрафные санкции за них, ситуации, требующие вмешательства военной полиции. Ей вменялось в обязанность пресекать пьянство, картёжные игры, воровство, неповиновение командирам. В документ входило и «Полевое уголовное уложение», квалифицировавшее такие преступления, как измена, дезертирство, неповиновение, кража, обмер, обвес и обсчёт, разбой, грабёж, насилие и меры наказания за них.

Часть третья «Учреждения для управления большой действующей армией» регламентировала деятельность интендантского управления «со всеми принадлежащими к оному частями». Обязанность генерал-интенданта состояла в «исправном и достаточном продовольствии армии во всех её положениях съестными припасами, жалованьем, одеждой, амунициею, аптечными веществами, лошадьми и подводами.

Создавалась чёткая структура интендантских служб, важнейшей из которых считалось полевое провиантское управление со своими органами в каждой армии, корпусе и дивизии. Регламентировалось буквально всё: от порядка закупок овса до правильного учёта курса различных валют. Финансовыми вопросами, обеспечением войск лекарствами, медикаментами, лошадьми и телегами занималось полевое комиссариатское управление.